在建设工程施工合同纠纷案件中，工程款结算往往是争议的核心焦点。其结算依据并非单一，而是由一系列法律文件、合同约定、事实行为及专业鉴定共同构成的复杂体系。本文结合相关法律规定及实务经验，对建设工程施工合同案件中工程款结算的主要依据进行梳理与分析。

一、 合同约定是结算的首要依据
根据《民法典》合同编及《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》（法释〔2020〕25号）的规定，当事人就同一建设工程订立的数份施工合同均无效，但建设工程质量合格，一方当事人请求参照实际履行的合同关于工程价款的约定折价补偿的，人民法院应予支持。这确立了“有约定从约定”的基本原则。具体而言，包括：

1. 施工合同本身：这是确定工程范围、计价方式（如固定总价、固定单价、可调价格）、付款节点、变更签证程序、索赔程序等最直接的依据。
2. 补充协议与会议纪要：在合同履行过程中，双方就设计变更、工程量增减、材料价格调整、工期顺延等达成的书面补充协议或会议纪要，是合同的重要组成部分，构成结算的直接依据。
3. 投标文件、中标通知书：当合同约定不明或存在矛盾时，招投标文件（尤其是投标报价书、已标价的工程量清单）和中标通知书的内容，可以作为确定合同价款及结算方式的参考。

二、 法律及司法解释的强制性规定是结算的底线
当合同约定不明、无效或存在显失公平的情形时，法律和司法解释的规定成为结算的强制性依据。

1. 工程质量合格是折价补偿的前提：无论合同是否有效，只要承包人施工的工程经竣工验收合格，或者虽未竣工验收但发包人擅自使用，承包人都有权请求参照合同约定支付工程价款（折价补偿）。这是《民法典》第七百九十三条确立的核心原则。
2. 关于工程量与计价标准的确定：当事人对工程量有争议的，按照施工过程中形成的签证等书面文件确认。若未能提供签证文件，但能证明发包人同意施工的，可以按照其他证据（如会议纪要、往来函件、施工记录、监理日志等）确认的实际工程量结算。对于计价标准，有约定的从约定；约定不明的，可参照签订合同时当地建设行政主管部门发布的计价方法或者计价标准结算。
3. 关于工程价款利息：当事人对欠付工程价款利息计付标准有约定的，按照约定处理。没有约定的，按照同期同类贷款利率或者同期贷款市场报价利率计息。利息从应付工程价款之日开始计付。

三、 履约过程中形成的书面文件是结算的关键证据
这些文件是合同履行的真实记录，能有效固定工程变更、工程量增减、工期延误、费用索赔等事实。

1. 工程签证文件：涉及设计变更、工程量确认、费用索赔、工期顺延等事项的现场签证单，经发包人、监理、承包人等各方代表签字确认后，是结算中最有力的证据之一。
2. 往来函件与联系单：双方就施工技术、材料确认、费用协商等事项的正式书面往来文件。
3. 施工图纸与竣工图纸：对比施工图与竣工图，可以直观反映施工过程中发生的工程变更。
4. 材料设备认价单：对于合同约定价格可调或暂估价的材料设备，经发包人确认价格的书面文件。

四、 第三方专业意见是结算争议的裁判辅助
当双方对工程量、工程质量、修复方案及费用等专业问题无法达成一致时，司法鉴定意见成为人民法院裁判的重要依据。

1. 工程造价司法鉴定：对工程造价的争议，当事人可以申请或由法院委托具有资质的工程造价咨询机构进行鉴定。鉴定机构将依据合同、图纸、签证、市场价格信息等资料，出具鉴定意见书。该意见书需经法庭质证后才能作为定案依据。
2. 工程质量检测与修复方案鉴定：对于是否存在质量缺陷、缺陷程度、修复可行性及修复费用等，可以委托具有相应资质的检测或鉴定机构出具专业意见。

与律师建议（安徽郭磊律师）
建设工程施工合同案件的工程款结算，是一个融合法律、工程、财务等多专业知识的复杂问题。对于发包方与承包方面言，为有效防范结算纠纷、保障自身权益，应做到：

1. 合同订立精细化：在合同中明确约定计价方式、变更签证程序、索赔程序、结算审核期限及逾期后果等关键条款。
2. 履约过程证据化：高度重视履约过程中所有书面文件的制作、流转与保管，确保每一份签证、联系单、会议纪要内容清晰、签章齐全。
3. 结算程序规范化：严格按照合同约定的程序和期限报送结算资料、提出审核意见，并保留好全部送达凭证。
4. 争议解决专业化：一旦发生结算争议，应及时咨询专业建设工程律师，梳理证据链条，评估诉讼风险，选择谈判、调解、诉讼或仲裁等最适宜的解决途径，必要时借助司法鉴定厘清专业事实。

综上，工程款结算的依据是一个多层次的体系。清晰有效的合同约定是基础，全面规范的履约证据是关键，而专业的法律与鉴定支持则是解决复杂争议的保障。